Экзаменационные вопросы по геномике и протеомике



страница3/4
Дата01.08.2018
Размер1,98 Mb.
ТипЭкзаменационные вопросы
1   2   3   4



В секвенировании лигированием (sequencing by ligation) на фазе, когда уже нужно распознавать нуклеотиды, используют не ДНК-полимеразу и процесс репликации, а специальные короткие «зонды», которые присоединяются к комплементарным нуклеотидам, фиксируются, затем вымываются, и процесс повторяется снова. Так устроен секвенатор SOLiD. В технологии SOLiD новая цепь ДНК синтезируется не добавлением единичных нуклеотидов (полимеризацией), а добавлением коротких блоков, олигонуклеотидов с длиной 8, комплементарных первой цепи, которые присоединяются с помощью фермента лигазы. В реакции используется смесь всех возможных олигонуклеотидов длиной 8 (48=65536 вариантов). Из-за малой длины их связывание с комплементарной нитью ДНК нестабильно, но если олигонуклеотид ложится встык с предыдущим, то лигаза соединяет их. Олигонуклеотиды помечены четырьмя разными флуоресцентными метками. Цвет метки определяется комбинацией двух первых (5′) нуклеотидов согласно некоторой кодовой таблице (16 комбинациям соответствуют 4 цвета). После лигирования считывают флуоресцентный сигнал, затем метку удаляют вместе с последними тремя нуклеотидами, пользуясь заложенной там расщепляемой связью. Таким образом, синтез идет шагами по пять нуклеотидов. Когда анализируемый участок пройден, новую цепь ДНК удаляют, и синтез повторяют несколько раз со всеми возможными сдвигами фазы, т.е. на один, два и т.д. нуклеотидов. Такие повторы не трудоемки, поскольку совершаются автоматически. Сопоставляя результаты всех прочтений, компьютер вычисляет последовательность ДНК.



Каталог: uploads
uploads -> Стоматология история открытий
uploads -> Санкт-Петербург Москва
uploads -> В интернатуру/ординатуру на конкурсной основе принимаются лица, имеющие высшее профессиональное образование
uploads -> Занятие №1 Эргономика в стоматологии. Ручные дентальные вращающиеся инструменты. Вспомогательные приспособления и средства для эстетической реставрации зубов, их назначение. Средства изоляции от ротовой жидкости
uploads -> Тема №1 Клинические и лабораторные этапы изготовления вкладок, виниров. Особенности одонтопрепарирования под вкладки, виниры. Моделирование вкладок, виниров из воска, пластмассы
uploads -> Дважды в день следует чистить зубы, межзубные промежутки, после чего полоскать ротовую полость с помощью ополаскивателя
uploads -> Профилактика кариеса и заболеваний десен
uploads -> Памятка после санации и/или после проведения профессиональной гигиены полости рта


Поделитесь с Вашими друзьями:
1   2   3   4


База данных защищена авторским правом ©stomatologo.ru 2017
обратиться к администрации

    Главная страница